Embedded Files
サンガーシーケンス（所内専用）
サンガーシーケンス（所内専用）
サンガーシーケンスサービスの概要
サンガーシーケンスサービスの概要
トランスオミクス解析室が窓口となり、所内サンプルをとりまとめて受託解析会社へ送付します。
トランスオミクス解析室が窓口となり、所内サンプルをとりまとめて受託解析会社へ送付します。
解析後、シーケンスデータはオンラインで提供されます。
解析後、シーケンスデータはオンラインで提供されます。
当室が窓口になることで、サンプル調製や諸手続の効率化と、安価な解析料金を実現しました。
当室が窓口になることで、サンプル調製や諸手続の効率化と、安価な解析料金を実現しました。
【サービス】
【サービス】
・BigDyeサイクルシーケンス反応及び泳動
・BigDyeサイクルシーケンス反応及び泳動
・シーケンス反応済みサンプルの泳動のみ行う（但し、受付サンプル数の制限有）
・シーケンス反応済みサンプルの泳動のみ行う（但し、受付サンプル数の制限有）
【納期】１営業日（サンプル到着日を０営業日とする）
【納期】１営業日（サンプル到着日を０営業日とする）
【サービスの流れ】
【サービスの流れ】
1. 受託解析業者のウェブサイトにて本サービス専用のアカウントを登録（初回のみ）
1. 受託解析業者のウェブサイトにて本サービス専用のアカウントを登録（初回のみ）
2. サンプル調製
2. サンプル調製
テンプレートDNAとプライマーを混合
テンプレートDNAとプライマーを混合
3. 解析依頼情報をwebサイトより入力
3. 解析依頼情報をwebサイトより入力
4. オーダーシート印刷、依頼サンプルと共にチャック付きポリ袋に同封
4. オーダーシート印刷、依頼サンプルと共にチャック付きポリ袋に同封
5. トランスオミクス解析室へ提出（所内便又は持参）
5. トランスオミクス解析室へ提出（所内便又は持参）
当日発送受付14時まで
当日発送受付14時まで
6. 受託解析会社にて解析
6. 受託解析会社にて解析
サイクルシーケンス反応（BigDye Terminator v.3.1)反応物精製
サイクルシーケンス反応（BigDye Terminator v.3.1)反応物精製
3730xlにてrun（50cmキャピラリー1時間run。600−700base程度。）
3730xlにてrun（50cmキャピラリー1時間run。600−700base程度。）
目視データ確認、不良サンプルは再泳動。
目視データ確認、不良サンプルは再泳動。
7. メールにて解析結果報告
7. メールにて解析結果報告
波形データ、ABI配列データ、テキストデータ添付
波形データ、ABI配列データ、テキストデータ添付
8. 会計処理
8. 会計処理
納品書、購入依頼書、解析完了メール本文のコピーを調達課へ提出。
納品書、購入依頼書、解析完了メール本文のコピーを調達課へ提出。
解析完了メール本文のコピー提出により検収となります（検収室への連絡は不要）。
解析完了メール本文のコピー提出により検収となります（検収室への連絡は不要）。
Sanger Sequencing (members only)
Sanger Sequencing (members only)
Overview of Sanger Sequencing Service
Overview of Sanger Sequencing Service
The Trans-Omics Facility serves as the main contact point, managing the collection of samples from laboratories and forwarding them to a contracted analysis company.
The Trans-Omics Facility serves as the main contact point, managing the collection of samples from laboratories and forwarding them to a contracted analysis company.
Once the analysis is complete, the sequencing data is made available online.
Once the analysis is complete, the sequencing data is made available online.
By centralizing this process, the institute streamlines sample preparation and related procedures, resulting in both improved efficiency and reduced analysis fees.
By centralizing this process, the institute streamlines sample preparation and related procedures, resulting in both improved efficiency and reduced analysis fees.
【Services】
【Services】
・BigDye Cycle Sequencing Reaction and Electrophoresis
・BigDye Cycle Sequencing Reaction and Electrophoresis
・Samples with pre-performed sequencing reactions are also accepted.
・Samples with pre-performed sequencing reactions are also accepted.
【Delivery Time】Results are delivered within 1 business day (the day the sample arrives is counted as day 0).
【Delivery Time】Results are delivered within 1 business day (the day the sample arrives is counted as day 0).
【Service Flow】
【Service Flow】
1. Register an account for this service on the contracted analyzer's website (required only for first-time users).
1. Register an account for this service on the contracted analyzer's website (required only for first-time users).
2. Sample preparation
2. Sample preparation
Mix template DNA and primers according to the guidelines.
Mix template DNA and primers according to the guidelines.
3. Enter the required analysis information on the the contracted analyzer's website.
3. Enter the required analysis information on the the contracted analyzer's website.
4. Print the order sheet and enclose it with the prepared sample in a resealable plastic bag.
4. Print the order sheet and enclose it with the prepared sample in a resealable plastic bag.
5. Submit the sample to the Trans-Omics Facility via in-house mail or in person. Same-day shipping is available until 2:00 p.m.
5. Submit the sample to the Trans-Omics Facility via in-house mail or in person. Same-day shipping is available until 2:00 p.m.
6. Analysis by contracted company
6. Analysis by contracted company
Cycle sequencing reaction (BigDye Terminator v.3.1). Purification of the reaction product.
Cycle sequencing reaction (BigDye Terminator v.3.1). Purification of the reaction product.
Sequencing using 3730xl (1-hour run on a 50 cm capillary, approximately 600-700 bases).
Sequencing using 3730xl (1-hour run on a 50 cm capillary, approximately 600-700 bases).
Visual data confirmation and reanalysis of defective samples as needed.
Visual data confirmation and reanalysis of defective samples as needed.
7. Analysis results are sent via e-mail, including waveform data, ABI sequence data, and text data.
7. Analysis results are sent via e-mail, including waveform data, ABI sequence data, and text data.
8. Accounting Process
8. Accounting Process
Submit a copy of the delivery note, the purchase order, and the text of the analysis completion e-mail to the Procurement Section.
Submit a copy of the delivery note, the purchase order, and the text of the analysis completion e-mail to the Procurement Section.
Acceptance inspection is completed upon submission of the e-mail text.
Acceptance inspection is completed upon submission of the e-mail text.
Page updated
Report abuse